Program Studi Teknik Lingkungan Universitas Hasanuddin dibuka pada tanggal 9 Februari 2009 berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi, Departemen Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor 166/D/T/2009. Program Studi Teknik Lingkungan (PS-S1-TL) mulai beroperasi pada September 2009 dengan Surat Keputusan izin operasional Nomor 166/d/t/2009. Sesuai dengan status Statuta Universitas Hasanuddin maka pada tanggal 2 Agustus 2017 berubah status menjadi Departemen Teknik Lingkungan sesuai dengan SK Rektor 21492/UN4.1/KL.06/2017 sehingga status Ketua Program Studi Teknik Lingkungan untuk periode 2013-2018 secara otomatis berubah menjadi Ketua Departemen Teknik Lingkungan sesuai dengan SK Rektor Nomor 21576/UN4.1/KP.15/2017. Perubahan status dari Program Studi dibawah naungan jurusan Teknik Sipil menjadi Departemen Teknik Lingkungan yang mandiri menunjukkan bahwa PS-S1-TL memadai untuk mengelola program studi secara mandiri yang tentunya didukung oleh sumber daya manusia yang memiliki kompetensi dan keahlian yang semakin berkembang serta sumber daya sarana dan prasarana yang sangat baik. Hal ini ditunjukkan dengan Peringkat (Nilai) Akreditasi Terakhir adalah A sesuai dengan surat keputusan BAN-PT Nomor 2085/SK/BAN-PT/Akred/S/VIII/2018 terhitung sejak tanggal 1 Agustus 2018 sampai dengan 1 Agustus 2023.

Program Studi Magister Teknik Lingkungan Universitas Hasanuddin didirikan pada tanggal 24 Juli 2019 berdasarkan Surat Keputusan yang dikeluarkan oleh Rektor Universitas Hasanuddin Nomor 3877/UN4.1/KEP/2019 dan SK Akreditasi Minimum dari BAN PT dengan Nomor 36/SK/BAN-PT/Min-Akred/M/VII/2019. Program Studi Magister Teknik Lingkungan mulai menerima mahasiswa baru pada Tahun Ajaran 2019/2020 dan dinyatakan terakreditasi dengan Peringkat (Nilai) Akreditasi Terakhir adalah Baik Sekali sesuai dengan surat keputusan BAN-PT Nomor 1902/SK/BAN-PT/Akred/M/III/2022 terhitung sejak tanggal 21 Maret 2022 sampai dengan 21 Maret 2027.